Только если дело касается роз, надо шишки и все такое прочее - опилки и солому, например, пропитывать раствором мочевины. Она нейтрализует кислоту, это раз, а два - не дает разлагающимся древесным остаткам обеднить почву азотом. Дело в том, что древесные остатки очень сильно забирают азот из почвы пока разложатся.
Оксана, очень правильно. Только надо выбирать правильный вид удобрения. Для лесных хвойных, рододендронов, голубики - сульфат аммония. Он подкисляет. А для прочих - мочевина.
Шишки розам не навредят. В Лондане в парках все розарии замульчированы корой и шишками толстым слоем. Если бы это было вредно, думаю вдяд бы они это делали.