Темная вода говорит о том, что она насыщена неразложившимися органическими веществами и гуматами, точнее гуминовыми кислотами, что характерно для верховых болот, где незавершились и очень медленно протекают биологические процессы. С одной стороны может показаться, что это хорошо, но сдругой это сигнализирует нам, что кислотность и торфа и соответственно воды будет повышена. Ваш торф и вода будут насыщены ионами кальция и магния, но бедны элементами питания. Следует вносить фосфорно-калийные удобрения, известковать почву (200-400 г/м.кв.), улучшать физический состав (добавка песка, глины), дренаж, если есть подболоченные места. Значит процесс обусловлен постоянным поступлением болотных вод и все эти процедуры придется проводить регулярно. Даже известкование поможет сделать доступными основные макроэлементы.А так - все хорошо.