Если дождь весь день, рекомендовал бы держать под спанбондом, он все-таки немного задерживает воду. Но высокая влажность, которая формируется под спанбондом и нарушается продувание, с другой стороны наличие спанбонда защищает растения от активного накопления капельножидкой влаги на поверхности. Сделайте так: во время дождя откройте томаты, посмотрите, если поверхность листьев просто влажная, то держите их под спанбондом, если поверхность листьев уже в каплях, т.е. спанбонд пропускает (недостаточно плотный) и уже капает вода, то лучше убрать этот спанбонд, он ничем не помогает.