Я думаю, что из-за температурного режима. Так растения реагируют, когда температура субстрата недостаточна и не сбалансирована (температура субстрата должна быть выше температурного минимума для конкретной культуры и на 1-2 градуса выше температуры воздуха в зоне роста). В условиях когда грунт "холодный" корень не способен растение обеспечить ни достаточным количеством питательных веществ, ни достаточным количеством воды при ярком солнце, он просто "не работает".
Похоже на бактериальную инфекцию, или может клещики какие завелись, они иногда живут на нижней стороне листа и такие повреждения оставляют Лучше поближе рассмотреть листья, может мелких вредителей увидите Попробуйте обработать биопрепаратами, как Агат-25К, Фитоспорин, они помогают против вредителей и болезней Поставьте ловушки для насекомых, может что поймаете Удачи с рассадой!